Seminários em Computação: Um arcabouço para inferência escalável de redes de regulação gênica temporais baseada em agrupamento e análise multivariada

• Responsável: Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação
• Câmpus: Santo André
• Local: Bloco A, auditório 205-0
• Data: 13/07/2016
• Horário: 16:00 às 17:20
• Descrição:

  Palestrante: Ricardo de Souza Jacomini (Escola Politécnica – USP)

  Título: Um arcabouço para inferência escalável de redes de regulação gênica temporais baseada em agrupamento e análise multivariada

  Resumo: Informações genômicas e transcriptômicas têm sido usadas como ponto de partida para análise da origem e desenvolvimento de doenças, levando ao desenvolvimento de muitos métodos que modelam a dinâmica dos dados de expressão gênica para inferência de redes gênicas. Entretanto, tais dados usualmente resultam em conjuntos de treinamento compostos por um pequeno número de amostras temporais com um grande número de genes. Neste seminário será apresentado um novo arcabouço para melhorar a escalabilidade do problema de inferência de redes gênicas. Tal arcabouço se baseia no modelo de redes gênicas probabilísticas com aplicação de uma técnica de agrupamento como pré-processamento. Além disso, uma análise de predição intrinsecamente multivariada é aplicada na rede resultante de forma a minimizá-la. Desse modo, mesmo com uma complexidade computacional reduzida, a metodologia proposta preserva a acurácia da inferência, o que a torna escalável para tamanhos reais de redes (milhares de genes).

• Necessita inscrição: Não
• Link de divulgação: http://poscomp.ufabc.edu.br/index.php/15-portuguese/seminarios-em-computacao/92-seminario-ricardo-de-souza-jacomini
• Calendário do Google: https://www.google.com/calendar/event?ei ...

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